本质：檀香为檀香科植物的心材，而沉香为沉香树的一种香脂和木质成分的固态凝聚物。
珍贵度：檀香较为常见，而沉香较为稀少，越南甚至将沉香列为国宝，禁止出口。
味道：檀香的香气更为典雅，而沉香的香气更为悠扬绵厚。
价格：檀香和沉香相比，前者价格较低。
一、本质区别
1、檀香：檀香为檀香科植物的心材，具有重要的药用价值，分布印度、马来西亚、澳大利亚及印度尼西亚等地，中国台湾亦有栽培。
2、沉香：沉香是其实是沉香树的一种香脂和木质成分的固态凝聚物，沉香树在自然界中被虫咬、风吹断枝、雷击等原因树干损伤后被真菌侵入寄生，在菌体内酶的作用下，侵蚀朽化使木材的薄壁细胞贮存的淀粉，产生一系列变化，形成香脂，最后经多年乃至千年的沉积形成了有香脂和木质成分的固态凝聚物。
二、珍贵度区别
1、檀香：檀香较常见，檀香有黄檀、小叶紫檀、红檀、黑檀、绿檀等等。
2、沉香：沉香相比就很稀少了，越南将沉香列为国宝，严禁出口，所以越来越少见到。沉香根据形成环境而分为土沉、水沉、蚁沉、倒架等等，原材又以奇楠为好，当然好的沉香不仅是价值连城，而且数量极其稀少。
三、味道区别
1、檀香：檀香的香气更典雅一些，由于闻之可以凝神静气，多为宗教所喜，目前市面上也有檀香的精油，涂抹在物件上，就会散发出浓郁的香气。
2、沉香：沉香的香气更为悠扬绵厚，并且香气较之檀香不同。
四、价格区别
1、檀香：檀香的价格稍低，还要看是不是真檀的，紫檀和香檀不同，价格也是不同的。
2、沉香：沉香的价格居高，上好的材料只有小小一块，而价格不好说的，因为其稀少，所以每年的价格都是不同的。
五、功效区别
1、檀香：檀香味辛，性温，无毒，入脾、胃、肺经，具有理气、和胃的功效，治心腹疼痛、噎膈呕吐、胸膈不舒等症。
2、沉香：沉香味辛、苦，性微温，归脾、胃、肾经，具有行气止痛、温中止呕、纳气平喘的功效，治胸腹胀闷疼痛、胃寒呕吐呃逆、肾虚气逆喘急等症。
